Die Speyside- Brennerei Glen Moray wurde 1897 durch Glen Moray Glenlivet Distillery Co. Ltd. erbaut. 1910 wurde die Destillerie geschlossen, aber 1912 wieder eröffnet und kurz darauf wieder geschlossen. 1920 wurde Glen Moray von Macdonald & Muir Ltd. gekauft, die 2 Jahre zuvor schon die Brennerei Glenmorangie übernommen hatten. 1923 wurde Glen Moray wieder eröffnet und 1958 renoviert. 1978 wurde das Mälzen aufgegeben. 1979 wurden die Stills von 2 auf 4 erweitert und 1992 die beiden älteren durch neue ersetzt. Macdonald & Muir nannten sich 1996 in Glenmorangie plc. um und wurden 2004 von Louis Vuitton Moët Hennessy übernommen. 2004 wurde ein neues Besucherzentrum eröffnet. Glen Moray wurde 2008 an La Martiniquaise verkauft. 2014 wurde die Destillerie um 2 Stills erweitert, 2015 wurden weitere 10 installiert.
Glen Moray spilet in der Geschichte des Whisky eine wichtige Rolle, weil Macdonald & Muir hier mit ihren Experimenten des Wood Finishing begannen, das ihre andere Destillerie Glenmorangie später damit berühmt machen machte.